Γεια,
Είμαι τελείως άσχετη... αλλά μήπως να δοκιμάσεις να κάνεις τροποποιήσεις στην ελληνική πλευρά του admin. Δηλαδή, κάνε login στο admin του καταστήματος και επέλεξε την ελληνική γλώσσα ώστε να βλέπεις όλο το admin στα ελληνικά. Μετά κάνε δοκιμή να βάλεις κάτι με ελληνικούς χαρακτηρες και τσέκαρέ το.
Δεν ξέρω γιατί, αλλά το admin μου λειτουργεί μια χαρά κατα αυτόν τον τρόπο και οι ελληνικοί χαρακτήρες στο μαγαζί μου φαίνονται κανονικά.